Bu liste oldukça uzun olmakla birlikte ehil kişilerce yapılan sünnetlerde bu oranlar oldukça duşüktür ve çoğu ile hiç karşılaşmayız. Bunları şöyle sayabiliriz; yara yerinde kanama, enfeksiyon, yetersiz sünnet, peniste eğrilik, ikinci bir idrar deliği oluşması, idrar deliğinin daralması, penis başının kesilmesi gibi.